ポケモンスクールの授業後、タケシとカスミがサプライズでスクールにやってきた。アローラ地方に来た2人のため、スクールのみんなで観光案内をすることに。まずはポケモンセンターへ行く一行。タケシは元気のないヤングースの治療のため、そこへ留まった。

そこへカスミがギャラドスを出してニャースロボギガ３号にワザを仕掛け、それに続いてサトシやスイレンたちもバトルに参加！無事マンタインを助け出すことに成功。さらに、カスミはギャラドスをメガシンカさせ、サトシ、カキ、スイレンはＺワザを出して、ロケット団にとどめをさした。

カスミとポケモンスクールのみんなは、パンケーキ屋へ行ったり、市場でおいしい果物を食べたり、アクセサリーショップへ行ったりと楽しんでいた。そんな中、マンタインサーフをみかけたサトシたちは、さっそくトライすることに。マンタインサーフで宝島へ出発！

マンタインサーフで宝島に到着したサトシたち。ここにはサトシの友だちがいるという。その友だちとは、なんとアローラナッシーだった。アローラナッシーにのって探検したり、いっしょに水遊びをしたりと宝島を満喫するカスミやサトシたち。たくさん遊んでまったりしているところに、とつぜん轟音がなりひびく。

音のあった方へ行くと、ニャースロボギガ３号がサトシたちののってきたマンタインを捕まえていた。ロケット団は本部での自分たちの存在が薄れてきていることを恐れ、大きな成果をあげようと、マンタインたちを狙っていたのだ。ピカチュウたちがワザを繰り出すが新しいニャースロボギガ3号には、全くきかない･･･！