空からメルタンの頭のナットを探すことにしたモクローたち。ひょんなことからロケット団と出くわし、偶然頭のナットを取り返すが、メルタンをゲットしようとするロケット団の反撃にあってしまう。モクローは体をはってニャースのみだれひっかきからメルタンを守ろうとする。ロケット団に攻撃を受けるモクローを見て、怒ったメルタンはラスターカノンを放ち、ロケット団の撃退に成功する。

ポケモンスクールでメルタンは、はぐれていた仲間たちと再会する。一度は仲間の元へ戻ろうとしたメルタンだったが、モクローのそばにいることを選び、サトシたちの仲間に加わることに。これからモクローとメルタンは良いコンビになりそうだ。

サトシたちが見つけた不思議な生き物はやはり新種のポケモンだった。オーキド博士によって「メルタン」と名づけられた新種のポケモンに、また会いたいと思うサトシ。実はメルタンはモクローとともにサトシのリュックの中にもぐりこんでいた。

頭のナットを失って悲しむメルタン。モクローはナットの代わりになるような、ありとあらゆる輪っか状のものを探してくるが、どれも納得がいかない様子のメルタン。一方、たまたまメルタンのナットを手に入れたロケット団は、壊れた車のナットの代わりにメルタンのナットを使っていた。

ポケモンスクールで、リュックから出たモクローと一緒にいたくてくっついて回るメルタン。そこへヤミカラスが現れ、メルタンを連れ去ってしまう。モクローはあわててメルタンを助けるが、その途中でメルタンは頭のナットをどこかへ落としてしまう。