サトシたちをさがすため、次にピカチュウたちが向かったのはポケモンスクール。しかし教室にもサトシたちの姿はなく、今度はウルトラガーディアンズとして出動し、サトシたちをさがすことに。ライドポケモンのガブリアスに「見晴らしのいいところ」へ連れて行ってほしいとお願いし、ピカチュウたちは雪の積もったウラウラ島のラナキラマウンテンにやってきた。

浜辺で目を覚ましたピカチュウは、野生のマケンカニにサトシの帽子を奪われてしまい、取り返そうとバトルに挑む。その隙にサトシの帽子をかぶって逃げるメルタンだったが、怒ったマケンカニにすぐに帽子を奪われてしまう。しかしメルタンの反撃を受け、マケンカニは完敗。帽子を取り返したピカチュウたちはルガルガンとモクローに合流するも、みんな疲れてお腹がペコペコに。

ピカチュウたちはソリで山を下りながらサトシを探すも、ソリから転落し海へダイブ！すると、メルタンがいないことに気づき、ピカチュウとルガルガンは海の中に潜って洞窟のような場所をさがすことに。空からメルタンをさがすモクローはホエルオーのしおふきと一緒に出てきたメルタンを発見！続いてピカチュウとルガルガンもホエルオーから噴出！どうやら洞窟だと思っていた場所はホエルオーの口の中だったようだ。そして、ホエルオーから勢いよく飛び出したピカチュウたちは、そのままどこかへ飛んでいってしまう。

サトシとニャヒートがセレビィの“ときわたり”に巻き込まれ過去に飛ばされていた間、ピカチュウ・ルガルガン・モクロー・メルタンは突如姿を消したサトシたちをさがし、森の中をさまよっていた。すると、茂みの向こうにサトシの帽子を見つける。大慌てで帽子を追いかけるが、それはサトシの帽子をかぶったウソッキーだった。

崖の上から香る“きのみ”のにおいに気付いたルガルガン。みんなで崖をかけ登るが、空腹のあまり“きのみ”の奪い合いに！びっくりしたピカチュウの“10まんボルト”や、怒ったメルタンの“ラスターカノン”で、みんなボロボロ…。そんな時だった、森の奥で不思議な光を目撃したピカチュウたち。光の方へ向かうと、そこにはサトシとニャヒートの姿が！大冒険の末、無事にサトシたちと再会し大喜びのピカチュウたちだった。