前半のバトルでのガオガエンの戦い方をいち早く吸収したサトシの機転と、それに応えるポケモンたちに感服するククイ博士。続いてサトシはニャヒートを、ククイ博士はガオガエンをバトルフィールドに繰り出し、因縁の対決が幕を開ける。ガオガエンの “ブラストバーン”の炎を吸収していたニャヒートの強力な “ニトロチャージ”が炸裂！力強い衝撃にガオガエンは体勢を崩してしまう。

お互いのゼンリョクのＺワザ“ダイナミックフルフレイム”が激しく衝突！出来上がった巨大な火の玉の中でニャヒートの“リベンジ”とガオガエンの“じごくづき”がぶつかり合う。静かになったフィールドで、先に倒れたのはガオガエンだった。バトルはニャヒートの勝利！勝利の咆哮を轟かせながら、ニャヒートは突如ガオガエンに進化！しかし、進化直後、立ったまま戦闘不能状態になっていた。

ガオガエンをモンスターボールに戻したサトシはいよいよククイ博士とのラストバトルに挑む。その時、上空から突然カプ・コケコが現れた！カプ・コケコは何とククイ博士の仲間としてサトシたちとバトルがしたいらしい。カプ・コケコをラストバトルのパートナーとして受け入れたククイ博士。アローラの守り神がトレーナーの指示のもとバトルするとあって、前代未聞の展開に会場中が大興奮！そしてサトシはアーゴヨンを繰り出した。ウルトラビーストＶＳアローラの守り神のバトルは一体どうなるのか!?

サトシVSククイ博士のエキシビションマッチは後半戦に突入。サトシのアーゴヨンとククイ博士のルカリオとの互角の戦いが続く。バトルは互いの“りゅうのはどう”対決へ持ち込まれるが、相打ちに。続いてアーゴヨンの“シザークロス”をルカリオが“インファイト”で受け止めるも、むしろそれを待っていたサトシは、アーゴヨンの“りゅうのはどう”をルカリオに向け至近距離から発動！ルカリオは戦闘不能に。アーゴヨンは初バトルを勝利で飾った。

“ビルドアップ”で力を増したガオガエンはニャヒートの“だいもんじ”をかき消し、“ほのおのキバ”で突撃してきたニャヒートを捕まえる。ニャヒートは身動きが取れないままガオガエンの“じごくづき”を食らってしまうが、再び立ち上がりパワーを急上昇させる。過去最大級にパワーを高めたニャヒート渾身の“リベンジ”にたまらず膝をつくガオガエン。負けじとガオガエンもパワーを高めていき、バトルは究極のＺワザ対決へ！