イーブイとスカル団のポケモンたちとのバトルはイーブイが優勢。しかししぶといスカル団たちにイリマ＆イーブイがついにＺワザを発動。シャワーズやブラッキーなど、イーブイの進化した姿のポケモンたちが勢ぞろいし力を与えるＺワザ「ナインエボルブースト」はものすごいパワーで、スカル団をけちらした。

サトシたちがポケモンスクールでわざの練習をしていると、スクールの卒業生・イリマがやってきた。 イリマはポケモンスクール始まって以来の秀才で、いろいろな伝説の持ち主といわれている。数ある伝説の中には、あのネッコアラもイリマ見たさに目を開けたというものも。

サトシはぜひイーブイのＺワザを見たいとイリマにバトルを申し込む。いざバトルをはじめようとしたその時、スカル団がやってきた。どうやらスカル団の一人がイリマを逆恨みしているようで、イリマにバトルをしかけてきた。大勢でイリマひとりに襲い掛かるスカル団。

ポケとびこみでイリマとの交流を深めたサトシたち。マーマネはイリマに、なぜイーブイを進化させないのかとたずねる。イリマは、イーブイのままでもすごい力を持っているからイーブイのまま強くしたいと答え、持っていたZクリスタルを見せる。それはイーブイＺといい、イーブイ専用のZクリスタルだった。

さっそくその伝説を見ようとイリマをたずねるサトシたち。しかしネッコアラの伝説はうわさにすぎなかった。しかし“木から飛んだ”という、イリマの別の伝説は半分本当だという。ポケモンスクールの木にはポケとびこみの台があり、イリマはポケとびこみをしていたのだった。さっそくポケとびこみにチャレンジするサトシたち。