ゴーストタイプのポケモンたちと遊ぶホウとスイだが、一人浮かない顔のアセロラ。ゴーストタイプのポケモンたちに気に入られすぎると連れて行かれるのだという。それを聞いたスイレンはホウとスイを呼び戻そうとするが、ムウマージに邪魔をされ、気が付くとポケモンスクールではない場所に。そこでパンプジンに行く手を阻まれている間、ホウとスイはいなくなってしまった。

ホウとスイを追って、不思議な世界へ入り込むスイレンたち。そこには羽根をつけて空を飛ぶホウとスイの姿が。スイレンたちは、二人を追いかけるが、またムウマージに邪魔をされ、みんなバラバラに飛ばされてしまう。

ある日、ホウとスイが、おばけ屋敷に行きたいと言い出した。ポケモンスクールでスイレンがみんなにその話をするが、アローラにはおばけ屋敷がない。たまたまスクールに来ていたアセロラのアイデアで、ポケモンスクールにおばけ屋敷をつくることに！

現実とかけはなれた不思議な世界で、ふとアセロラが自分たちはムウマージの作った夢の中にいるのではないかと言い出す。スイレンは何とか夢から覚めようと、そこに現れたネッコアラに助けを求めた。するとネッコアラがスクールの鐘を鳴らし、無事みんな夢から覚めたのだった。

ホウとスイのために、サトシたちが手づくりのおばけでこわがらせようとするが、全くこわがらないホウとスイ。そんな中、色んなものが宙に浮く不思議な現象が起こり、サトシたちはとまどう。アセロラのカゲボウズが「みやぶる」を使うと、そこにはゴーストタイプのポケモンたちが。