サクラギ研究所宛に大量の野菜と手紙が届いた。サクラギ博士の教え子で、今は農業をしているエンドウから送られたものだ。手紙によると、近頃急にディグダとダグトリオがエンドウの畑を荒らしはじめたので、とても困っているのだという。ディグダたちがなぜそんなことをするのか？サトシとゴウ、そしてコハルはエンドウの畑に調査へ行くことに！！